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https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/10859
???metadata.dc.type???: | Dissertação |
Title: | Alelos de HLA-ABDR genérico e variantes do gene TNFA em indivíduos com tuberculose |
Other Titles: | Generic HLA-ABDR alleles and TNFA gene variants in individuals with tuberculosis |
???metadata.dc.creator???: | Queiroz, Alliny Almeida ![]() |
???metadata.dc.contributor.advisor1???: | Sadahiro, Aya |
First advisor-co: | Ogusku, Maurício Morishi |
Second Advisor-co: | Figueira, Mariana Brasil de Andrade |
???metadata.dc.contributor.referee2???: | Almeida, Sandro Rogério de |
???metadata.dc.contributor.referee3???: | Sato, Paula Keiko |
???metadata.dc.description.resumo???: | A tuberculose (Tb) é uma doença infecciosa, causada por micobactérias do complexo Mycobacterium tuberculosis, sendo a espécie que mais acomete o homem M. tuberculosis. O estado do Amazonas tem um dos maiores coeficientes de incidência da Tb do Brasil, com 81,6 casos de Tb/100 mil habitantes. Na capital Manaus, os números são ainda mais preocupantes por apresentar a incidência de 113,2 novos casos de Tb/100 mil habitantes. A Tb é uma doença associada a fatores como a condição socioeconômica, nutricional, ambiental e perfil genético do hospedeiro, bem como virulência do bacilo. As características genéticas dos indivíduos com Tb têm sido frequentemente exploradas, tais como os genes de HLA (Antígeno Leucocitário Humano) e SNVs (Variantes de Nucleotídeo Único) que regulam as respostas imunológicas em diversas doenças. O presente estudo teve como objetivo avaliar a frequência dos alelos de HLA genérico (A, B e DR) e de SNVs do gene TNFA, rs1799964 e rs1800610. A tipagem do HLA foi realizada por PCR-SSP (sequence specific primer) em 148 amostras, sendo 51 indivíduos com Tb pulmonar, 10 com Tb extrapulmonar e 87 controles. Após análise, o HLA-A*29 foi associado a suscetibilidade a Tb (p= 0,0005; OR= 4,31; IC95%= 1,869 – 9,504), ao passo que os HLA-A*31 (p= 0,0002; OR= 0,06; IC95%= 0,0057 – 0,3384), HLA-A*68 (p= 0,0175; OR= 0,122; IC95%= 0,0112 – 0,6990) e HLA-DRB1*14 (p= 0,027; OR= 0,248; IC95%= 0,0756 – 0,8162) foram associados a proteção a Tb. A genotipagem do SNV TNFA foi realizada por qPCR em 913 amostras, sendo 355 indivíduos com Tb pulmonar, 86 indivíduos com Tb extrapulmonar e 472 controles. Para o gene de TNFA, somente o rs1800610 apresentou associação à Tb nos seguintes modelos genéticos: dominante (p= 0,035; OR= 1,37; IC95%= 1,02–1,83), overdominante (p= 0,028; OR= 1,40; IC95%= 1,04–1,90) e log-Additive (p= 0,056; OR= 1,27; IC95%= 0,99–1,64). Os nossos resultados sugerem que as moléculas de HLA podem estar associadas a Tb, influenciando na resposta aos linfócitos T, mas como o sistema HLA é hiperpolimórfico, estes resultados devem ser avaliados com cautela. O gene de TNFA, rs1800610, foi associado a suscetibilidade a Tb, o que nos estimula a investigar as regiões gênicas da via de sinalização e produção de TNF-α, bem como as citocinas envolvidas durante a infecção por M. tuberculosis. |
Abstract: | Tuberculosis (Tb) is an infectious disease caused by mycobacteria of the complex Mycobacterium tuberculosis, being the species that most affects the man M. tuberculosis. The state of Amazonas has one of the highest incidence coefficients of Tb in Brazil, with 81,6 cases of Tb/100.000 inhabitants. In the capital Manaus, the figures are even more worrying because they present the incidence of 113,2 new cases of Tb/100.000 inhabitants. Tb is a disease associated with factors such as socioeconomic, nutritional, environmental and genetic profile of the host, as well as virulence of the bacillus. The genetic characteristics of individuals with Tb have often been explored, such as the HLA (Human Leukocyte Antigen) and SNVs (Single Nucleotide Variants) genes that regulate immune responses in several diseases. The present study aimed to evaluate the frequency of generic HLA alleles (A, B and DR) and SNVs of the TNFA gene, rs1799964 and rs1800610. HLA typing was performed by PCR-SSP (sequence specific primer) in 148 samples, 51 individuals with pulmonary Tb, 10 with extrapulmonary Tb and 87 controls. After the analysis, the HLA-A*29 was associated with Tb susceptibility (p= 0,0005; OR= 4,31; IC95%= 1,869 – 9,504), while HLA-A*31 (p= 0,0002; OR= 0,06; IC95%= 0,0057 – 0,3384), HLA-A*68 (p= 0,0175; OR= 0,122; IC95%= 0,0112 – 0,6990) e HLA-DRB1*14 (p= 0.027; OR= 0.248; IC95% = 0.0756 - 0.8162) were associated with Tb protection. Genotyping of SNV TNFA was performed by qPCR in 913 samples, being 355 individuals with pulmonary Tb, 86 individuals with extrapulmonary Tb and 472 controls. For the TNFA gene, only rs1800610 showed association with Tb in the following genetic models: dominant (p= 0.035; OR= 1.37; IC95% = 1.02-1.83), overdominant (p= 0.028; OR= 1.40; IC95% = 1.04-1.90) and log-Additive (p= 0.056; OR= 1.27; IC95% = 0.99-1.64). Our results suggest that HLA molecules may be associated with Tb, influencing the response to T lymphocytes, but as the HLA system is hyperpolymorphic, these results should be evaluated with caution. The TNFA gene, rs1800610, was associated with Tb susceptibility, which stimulates us to investigate the gene regions of the TNF-α signaling and production pathway, as well as the cytokines involved during infection by M. tuberculosis. |
???metadata.dc.subject.cnpq???: | CIENCIAS BIOLOGICAS: IMUNOLOGIA:: MUNOLOGIA APLICADA |
???metadata.dc.subject.user???: | Tuberculose HLA SNVs TNFA Imunogenética |
Language: | por |
???metadata.dc.publisher.country???: | Brasil |
Publisher: | Universidade Federal do Amazonas |
???metadata.dc.publisher.initials???: | UFAM |
???metadata.dc.publisher.department???: | Instituto de Ciências Biológicas |
???metadata.dc.publisher.program???: | Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada |
Citation: | QUEIROZ, Alliny Almeida. Alelos de HLA-ABDR genérico e variantes do gene TNFA em indivíduos com tuberculose. 2025. 87 f. Dissertação (Mestrado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus (AM), 2025. |
???metadata.dc.rights???: | Acesso Aberto |
???metadata.dc.rights.uri???: | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
URI: | https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/10859 |
Issue Date: | 27-Mar-2025 |
Appears in Collections: | Mestrado em Imunologia Básica e Aplicada |
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