@PHDTHESIS{ 2018:1623545537,
 	title = {Transcriptoma de Copaifera multijuga Hayne: montagem e anotação},
 	year = {2018},
 	url = "https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6728",
 	abstract = "Copaifera multijuga Hayne é uma espécie de planta de grande porte,
 popularmente conhecida como copaíba, nativa da América Latina e da África.
 São amplamente utilizadas na medicina popular amazônica, devido as
 propriedades do óleo-resina extraído do tronco de suas árvores, utilizado
 principalmente como: diurético, laxativo, antitetânico, anti-inflamatório,
 antitussígeno, cicatrizante e anti-tumoral. Sendo, portanto, de grande
 importância para pesquisas que visem identificar nas plantas substâncias com
 potenciais finalidades médicas e biotecnológicas. Por isto, este trabalho visou
 pesquisar o transcriptoma de C. multijuga Hayne, o qual foi sequênciado
 utilizando a plataforma 454 Roche, sendo obtido um total de 638.576 reads,
 montados através da metodologia de novo com auxílio das plataformas MIRA e
 TRINITY. Sendo gerados, a partir da montagem por TRINITY 53.319 contigs e
 62.839 pela montagem MIRA. A anotação do transcriptoma foi realizada
 utilizando BLASTx (NCBI) e a anotação funcional através do banco Gene
 Ontology (GO). Os resultados obtidos foram categorizados de acordo com GO,
 onde os unigenes foram agrupados nas categorias: “Componente Celular” com
 6.249 contigs envolvidos nesta categoria, “Função Molecular” com total 17.208
 contigs e “Processo Biológico” com 9.499 contigs. Nas três categorias os
 contigs evidenciados estão envolvidos no metabolismo primário vegetal. Já do
 metabolismo secundário foram detectados 184 unigenes, sendo organizados
 em 22 clusters, envolvidos principalmente em respostas ao estresse oxidativo
 vegetal, compostos terpenos, importantes metabólitos envolvidos na formação
 do óleo-resina de copaíba, diterpenos (porção resinosa do óleo-resina) e
 sesquiterpenos (componentes voláteis do óleo) e unigenes relacionados com a
 pigmentação vegetal tais como: flavonóides, carotenóides e antocianinas. Na
 análise filogenética foram feitas comparações evolutivas de enzimas de
 terpenos sintases, componentes de formação do óleo de copaíba, com
 enzimas do banco de dados NCBI. O unigene de TPS4-2 de C. multijuga
 mostrou-se mais próximo a outras sequências de terpenos TPS4-2 de
 Copaifera disponíveis no banco. Com isto, neste trabalho realizou-se o
 transcriptoma de C. multijuga com a montagem de novo e anotação o que leva
 a perspectiva de estudos com os unigenes codificadores de enzimas
 componentes do óleo-resina evidenciados neste trabalho, visando com isto
 futuras pesquisas para fins biotecnológicos.",
 	publisher = {Universidade Federal do Amazonas},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia},
 	note = {Instituto de Ciências Biológicas}
}